O Aluno Do Ensino Médio Ling Xiaoyu É Recrutado Por Anna Williams, Da G Corporation, Para Se Transferir Para A Universidade De Kyoto E Coletar Informações Sobre Um Aluno Chamado Kamiya Shin. Enquanto Isso, Kazama Jin, O Atual Chefe De Themishima Zaibatsu, Envia Alisa Bosconovitch Para A Universidade Para A Mesma Missão. Embora Eles Não Conheçam Os Verdadeiros Motivos Um Do Outro, Xiaoyu E Alisa Se Tornam Amigos Íntimos. No Entanto, A Amizade Deles É Posta À Prova Quando Shin É Capturado Por Um Agressor Desconhecido.